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提到西醫與中醫對喝咖啡的不同觀點：西醫或西方營養學都是分析咖啡裡的成分，而中醫則是以咖啡的整體性，來判斷對人的影響。
接下來，我們來探索抗生素對身體的影響。
西醫常常會使用抗生素殺掉外來的細菌，但後來發現抗生素也會把腸道菌殺死，也就是好菌、壞菌都殺！近年的研究，則漸漸揭開腸道菌對人體健康的幫助，所以把好菌殺死了，人體就會開始出現各種病症！
中西醫對外來菌採取截然不同的方法：
西醫是研究哪種菌侵襲身體，就研發能夠殺死那種菌的藥物，但會越用越沒效，因為細菌會不斷演化產生抗藥性；另一方面，西醫的方式會讓自身的免疫系統無用武之地，沒有練兵的機會，就得不到應有的訓練，而且外來藥物的越俎代庖，也會使人體原本的指揮系統越來越困惑、混亂。
中醫則是不管入侵身體的是哪種細菌，重點是讓失衡的五臟六腑恢復平衡，就能讓自己的免疫系統去對抗外來細菌，因為自己的免疫系統才可以分辨哪些該殺、該驅趕出去；哪些不該殺、該好好保護；另一方面，五臟六腑的平衡也可建立外來細菌不易生長的環境。
以下分別探討：
一.認識抗生素：
抗生素（英語：antibiotic）又名抗菌素，是微生物（例如：放線菌）的代謝產物或人工合成的類似物，其主要用途是抑制其它種類微生物的生長（抑菌作用）或將它們殺死（殺菌作用），在定義上是一較廣的概念，包括抗細菌抗生素、抗真菌抗生素以及對付其他微小病原之抗生素；但臨床實務中，抗生素常常是指抗細菌抗生素。抗生素的副作用之一是使腸道正常菌群失調。
https://zh.m.wikipedia.org/zh-tw/%E6%8A%97%E7%94%9F%E7%B4%A0
二.體內微生物的重要：
1.「想念曾經並肩作戰的老朋友」：
摘錄：
（1）人體內的微生物，都是在演化長河裡跟著我們的動物祖先們一路奮鬥過來的伙伴。
（2）抗生素無差別地消滅病原菌時，人體內的微生物也同時在這些毒藥的攻擊下死去，一個一個從人類身體裡撤守消失。
（3）人類的腸道裡住著數百種細菌，但我們對腸道菌所知有限。它們可能也曾經住過我們祖先的腸道裡，並且以特殊的代謝能力，幫助人類甚至動物的祖先在這個星球上活了下來。
（4）這些我們身體天天親密接觸的異種生命，和人類的細胞系統早就熟識，但是我們在科學上對他們的瞭解卻很少。
（5）抗生素的出現大幅延長了人類的壽命，不過抗生素無差別式的殺菌效果卻是不分敵友。
（6）糖尿病、氣喘、肥胖、過敏、胃食道逆流、發炎性腸道病這些現代疾病，或許都跟抗生素的使用有點關係。
正文：
本文為《不該被殺掉的微生物：濫用抗生素如何加速現在瘟疫的蔓延》一書之推薦序，由慈濟大學生命科學系助理教授，同時也是泛科學專欄作者「細菌人」陳俊堯老師 撰寫。
請想像下面這個狀況。你有一些工作上的伙伴，都是認識很久的老戰友。這些人能力強但難搞，不過你知道怎麼和他們相處。阿權龜毛得要死，你知道要留時間放手讓他做、別管太多。丁丁敢衝但是漏東漏西，合作時要多替他注意細節。小杜害羞內向但是細心，該讓他留守不要去找客戶談。在一個團隊裡待久了，你知道每個人的脾氣，也知道在遭遇不同狀況時該由誰出來搞定。這是一個可以信賴的團隊，有戰力的團隊，跟你們同期的公司倒了很多，唯獨這個團隊經過風風雨雨，不但撐過來了，而且成員們的互補還讓戰力變得更強。
但是突如其來的挖角，把一些成員帶走了。雖然也有不錯的新人補位，但畢竟不是老班底。你開始擔心，這個團隊還能不能維持原來的戰力，會不會走不下去了？
其實我也擔心，人類族群會不會也走不下去。
這本書的標題明確地指出問題的核心，要我們注意那些曾經存在人體內的微生物。在過去的觀念裡，微生物都不是好東西，我們巴不得看到它們全部消失。但是這些逐漸消失的微生物，都是在演化長河裡跟著我們的動物祖先們一路奮鬥過來的伙伴，在我們驕傲地使用抗生素武器、無差別地消滅膽敢接近我們身體的病原菌時，卻沒注意到過去的伙伴也同時在這些毒藥的攻擊下死去，一個一個從人類身體裡撤守消失。
而本書作者馬丁．布雷瑟醫師（Martin J. Blaser, MD）在研究上的豐富資歷，讓我們相信這份擔憂是必要。布雷瑟醫師是這個領域裡頂尖的研究者，名字出現在超過六百篇的研究論文上，從彎曲桿菌研究到幽門螺旋桿菌，近年關注低劑量抗生素對腸道菌相及宿主的影響，到 2016 年的研究都還是走在浪潮的前端。這位資深的研究者還寫了你手上的這本書，要讓更多人注意到這個問題。一些近年眾所矚目的細菌議題，例如多重抗藥性超級細菌、飼料添加抗生素促進動物生長、肥胖菌相等議題都包含在這本書的範圍裡。
人類的腸道裡住著數百種細菌，但到目前為止能在實驗室裡培養，而有機會被仔細研究的種類，大概僅有一半，所以我們對腸道菌所知有限。這些借居在我們體內的微生物種，可能也曾經住過我們祖先的腸道裡，並且以它們特殊的代謝能力，幫助人類甚至動物的祖先在這個星球上活了下來。這些我們身體天天親密接觸的異種生命，和人類的細胞系統早就熟識，但是我們在科學上對他們的瞭解卻很少。
多年來的默契讓我們的細胞在知道細菌要來前，就先幫它們留點什麼或備點什麼等著。就像你從經驗知道，室友回到寢室看到你的宵夜一定會分走一半，所以你早有準備，買了雙份雞排等著賣他。不過萬一你什麼都準備好了，那個跟你生活在一起的傢伙卻沒有出現呢？雙份雞排自己吃掉就好，但是少了細菌後我們身體過頭的反應就可能變成疾病。抗生素的出現大幅延長了人類的壽命，不過抗生素無差別式的殺菌效果卻是不分敵友，這樣一來也就增加了晚上等不到「室友」回家的機會。糖尿病、氣喘、肥胖、過敏、胃食道逆流、發炎性腸道病這些現代疾病，或許都跟抗生素的使用有點關係。
團體裡有的人是刀子嘴豆腐心，看起來冷漠甚至帶有敵意，但卻是會默默幫別人瞻前顧後的低調救世主。你工作的團體裡有沒有這樣的人？或許你的肚子裡會有。作者提出證據說明，這些過去被我們認定的病原菌，或許可以從另一個角度來評斷它們的功過。拿會住在我們胃部的幽門螺旋桿菌為例。幽門螺旋桿菌被證實是造成胃潰瘍的病原菌，但是帶有幽門螺旋桿菌的人，胃食道逆流罹患率竟然比較低，罹患氣喘的可能性也比較低。是不是有一種可能，我們的祖先在長年的演化篩選中兩害相權取其輕，選擇幽門螺旋桿菌的人反倒過得比較好。我們這些後代子孫自以為發現了禍害根源，用抗生素除掉了這些被祖先保留下來的細菌。如果真的是這樣，那在過去被細菌封印的（我們還不知道的）惡魔，是不是就變成了纏住我們的現代瘟疫呢？這樣的看法可能會在未來改變醫學治療的面貌，讓我們得以更細緻地去處理細菌與我們細胞間的互動關係，而不是拿抗生素來粗暴地大屠殺。
你或許被作者說服了，瞭解服用抗生素可能會有失去微生物夥伴的風險，但是當你躺在醫院裡，知道細菌在你血液裡游來游去時，你還是希望醫生趕快用抗生素來幫你戰勝病原菌。作者在最後一章告訴我們，在這個我們必須重新學習跟體內細菌相處的時代，該怎麼做才能降低不小心消滅這些肉眼看不見的盟友。
⋯⋯⋯⋯略⋯⋯⋯⋯
人體細胞和細菌和平「共生」已有數十萬年之久。它們的共生維護了人體的平衡與健康。但是現在這個伊甸園卻因為我們過度依賴抗生素、剖腹產等現代醫藥、醫術而備受干擾，成為一片荒野，那些無可取代的微生物似有滅絕之勢，且將引發人類嚴重的健康問題。
（文未完，完整文章請進入網址：https://pansci.asia/archives/100845）
這樣的說明，應該可以了解我們體內的微生物對健康是多麼重要了吧！接下來則是近年漸漸受到重視的「腸-腦軸線」！
2.認識「腸-腦軸線」：大腦與消化道的密切關係！
（1）腸—腦軸線（英語：gut–brain axis），也叫腸腦軸，是大腦和腸消化道兩個器官間的溝通橋梁，而其中腸道中的菌群也對此路徑貢獻匪淺，三者相互影響並調控全身各種生理作用，從腦部早期發育到晚期老年的神經疾病的皆與此連結軸線有著密切的關係。腸—腦軸線這個詞已延伸來描述腸道菌種與腸道表皮細胞交互作用中的角色，有時也會用菌—腸—腦軸線（microbiome–gut–brain axis）具體指出菌種在其中的角色[1][2][3]。
（2）以較廣的定義來看，腸—腦軸線包括中樞神經系統、中樞內分泌系統及中樞免疫系統，其中包括下視丘—垂體—腎上腺軸（HPA軸）、自主神經系統中的交感神經系統、副交感神經系統（迷走神經）及腸神經系統，以及腸道中的微生物群[1][3]在動物體的腸胃表面最主要被自主神經系統所連結支配，但在腸胃道中的菌相的刺激下，也會促使腸道表皮細胞分泌生理調控訊息，而此生理調控訊息除了會誘導產生局部免疫反應外，更會經由和其連結的自主神經系統，將生理訊息傳送至大腦中樞，進而影響到中樞內分泌系統及中樞免疫系統。
（3）研究者對此領域開始關注的原因是因為2004年的一篇研究，發現腸道中沒有菌種的小鼠，其HPA軸對壓力的反應比一般腸道中有菌種的小鼠要誇張許多[1]。因此目前在實驗室或是人體臨床的研究，主要針對腸道菌種在腸—腦軸線中的角色進行分析，以及分析腸道菌相刺激腸—腦軸線產生的神經傳導物質，如血清素、多巴胺、乙醯膽鹼、γ-氨基丁酸對大腦中樞神經系統的影響。或是研究人在不同精神狀態下，大腦經由腸—腦軸線對腸道菌種的生長調節變化。因此可以了解到，菌-腸—腦軸線是雙向的生理調控管道，和發育及身心健康息息相關。在過去近20年的研究中，科學家已清楚地注意到腸道菌相對人體重要性，且在臨床上證實，在破壞菌—腸—腦軸線的平衡時，會誘導自體免疫系統對神經系統的攻擊，導致多發性硬化症。這是一種脫髓鞘性神經病變，患者腦或脊髓中的神經細胞表面的絕緣物質受到破壞，造成神經系統的訊息傳遞受損，導致一系列可能發生的症狀，影響患者的運動功能、心智能力、甚至精神狀態的損傷[4][5][6]。
（4）另外，在分析自閉症兒童的腸道菌相中，也發現其糞便中的菌相與健康兒童有著明顯差異。Sarkis Mazmanian 的研究團隊進一步的將自閉症兒童的腸道菌餵食小鼠，發現在餵食自閉症兒童腸道菌的小鼠中，不僅會改變小鼠腸道菌相，更誘導小鼠產生明顯的自閉症行為[7][8][9][10]。然而菌—腸—腦軸線不僅僅是對兒童發育有著顯著關聯性，其對老年人的精神疾病也有明顯影響。臨床上帕金森氏症病人的腸道菌相也與健康人明顯不同。2019年 Ted Dawson、Han Seok Ko 發現「由腸到腦」帕金森氏症造症原因。證實在小鼠腸道中的病源型突觸核蛋白可經由迷走神經的傳遞，進而運送到運動神經元，過多的病源型突觸核蛋白的累積造成路易體形成及細胞氧化壓力和發炎，導致了運動神經元的壞死，進而造成病人顫抖、肢體僵硬、運動功能減退[11][12]。
https://zh.m.wikipedia.org/zh-tw/%E8%85%B8%E2%80%94%E8%85%A6%E8%BB%B8%E7%B7%9A
延伸閱讀：
西方醫學也發現抗生素會殺掉好菌，所以提出要重建腸道菌，而且除了讓好菌回來，還要重建讓腸道菌生長的「土壤」：
三.西方醫學的觀點：
抗生素救命，也會殺光好菌 - 真正關鍵在於後續怎麼重建
很多人以為，抗生素吃完，感染控制住了，就是結束。但其實，那只是第一步。
抗生素的確能有效清除壞菌，可是在這個複雜如熱帶雨林的腸道裡，它一出手，常常是連好菌也一併消滅。這就像為了除蟲放了一場大火，雖然病蟲害沒了，但整片森林也被燒得一乾二淨。
這時如果沒有接著做「重建」，腸道就像一片焦土，沒有防禦力、沒有平衡，壞菌一有機會就捲土重來，感染也會跟著反覆發生。
前面提到那位80歲反覆泌尿道感染的女士，就是活生生的例子：抗生素短期有效，但菌叢沒有恢復、沒有守門員，壞菌很快就再度侵入，形成「治療—復發—再治療」的惡性循環。真正讓她走出來的，不是更強的藥，而是「讓菌回來」。
那麼，該怎麼讓菌回來？這裡面其實有很多細節。
發表在2025年期刊《Nature》的研究，透過精密的實驗，點出了「重建腸道菌叢」的幾個核心概念。它不只證明了重建的重要，更具體告訴我們：什麼樣的飲食能幫助菌叢回來？什麼樣的環境能讓補進去的菌活得下來？而哪些習慣，其實正在悄悄拖慢我們的恢復？
簡單說，重建不只是吃個益生菌膠囊那麼簡單。補菌之後，腸道裡是否有「糧草」讓它們存活、是否有「朋友」讓它們合作，才是決定效果的關鍵。這些，就是我們接下來會談的「怎麼重建」的具體方法。
養菌要養「土壤」，不是只撒種子
菌叢想要回家，不只需要補菌，更需要能讓它們活得好的環境。這篇研究強調一個關鍵詞：「交互代謝作用」 — 意思是菌與菌之間會合作消化纖維，互相產出有用的營養物質，比如丁酸、醋酸、丙酸，這些都對腸道修復、免疫穩定非常重要。
但如果我們每天吃的是油炸、甜食、加工食品，好菌就沒東西吃，壞菌反而會趁虛而入。這就是為什麼那位80歲老太太，每次抗生素治療完好像好了，其實身體裡的菌叢根本沒修好，感染自然一再找上門。
延伸閱讀：
1.「菜要多吃一點」不是媽媽碎念 - 最新研究揭露：蔬菜裡的纖維真的能幫身體打贏感染這場仗
2.「便秘」、帕金森、腸道菌和化學毒素之間，藏著一場看不見的神經風暴
所以西方醫學也承認抗生素好壞菌都殺，而且好菌被殺後，感染很容易重複發生，所以要重建腸道菌，那能不能一開始就只殺壞菌、不殺好菌？有！就是中醫！下一篇就是有中西醫雙執照，而以中醫執業的陳嘉帆醫師的實際經驗。這篇先介紹西方對抗生素影響身體的研究與發現。
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人智學 (13)